資料來源
本專案使用的資料庫與來源說明
資料來源總覽
| 資料類型 | 來源 | 用途 |
|---|---|---|
| AI 預測 | TxGNN | 藥物-疾病關聯預測 |
| 臨床試驗 | ClinicalTrials.gov | 驗證臨床證據 |
| 學術文獻 | PubMed | 驗證研究證據 |
| 藥物資訊 | DrugBank | 藥理機轉說明 |
| 台灣許可 | TFDA | 台灣上市資訊 |
| 藥物交互 | DDInter, GtoPdb | DDI 資訊 |
TxGNN 模型
簡介
TxGNN 是由哈佛醫學院 Marinka Zitnik 教授團隊開發的藥物再利用預測模型。
論文資訊
- 標題：A foundation model for clinician-centered drug repurposing
- 期刊：Nature Medicine (2023)
- DOI：10.1038/s41591-023-02233-x
資料規模
| 項目 | 數量 |
|---|---|
| 節點數 | 17,080 |
| 藥物數 | 4,465 |
| 疾病數 | 2,870 |
| 已知藥物-疾病關聯 | 14,573 |
資料下載
ClinicalTrials.gov
簡介
美國國家衛生研究院 (NIH) 維護的全球最大臨床試驗登記資料庫。
網址
使用方式
- 透過 API 搜尋藥物名稱 + 疾病名稱
- 收集試驗編號、階段、狀態、人數等資訊
收集欄位
| 欄位 | 說明 |
|---|---|
| NCT Number | 試驗唯一識別碼 |
| Phase | 試驗階段 (Phase 1-4) |
| Status | 試驗狀態 |
| Enrollment | 受試者人數 |
| Conditions | 研究的疾病 |
| Interventions | 介入措施（藥物） |
PubMed
簡介
美國國家醫學圖書館 (NLM) 維護的生物醫學文獻資料庫。
網址
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/
使用方式
- 透過 E-utilities API 搜尋
- 藥物名稱 + 疾病名稱作為關鍵字
收集欄位
| 欄位 | 說明 |
|---|---|
| PMID | PubMed 唯一識別碼 |
| Title | 文章標題 |
| Year | 發表年份 |
| Journal | 發表期刊 |
| Abstract | 摘要內容 |
| Publication Type | 文獻類型 |
DrugBank
簡介
加拿大 OMx Personal Health Analytics 維護的綜合藥物資料庫。
網址
收集欄位
| 欄位 | 說明 |
|---|---|
| DrugBank ID | 藥物唯一識別碼 |
| Name | 藥物名稱 |
| Mechanism of Action | 作用機轉 |
| Pharmacodynamics | 藥效學 |
| Indication | 適應症 |
衛福部食藥署 (TFDA)
簡介
台灣衛生福利部食品藥物管理署，負責藥品許可證管理。
資料來源
收集欄位
| 欄位 | 說明 |
|---|---|
| 許可證號 | 藥品許可證字號 |
| 中文品名 | 藥品中文名稱 |
| 英文品名 | 藥品英文名稱 |
| 劑型 | 藥品劑型 |
| 適應症 | 核准適應症 |
| 許可證狀態 | 有效/註銷 |
藥物交互作用 (DDI)
DDInter 2.0
- 網址：https://ddinter2.scbdd.com/
- 規模：302,516 DDI 資料、2,310 藥物
- 用途：藥物-藥物交互作用資訊
Guide to PHARMACOLOGY (GtoPdb)
- 網址：https://www.guidetopharmacology.org/
- 維護：IUPHAR/BPS
- 用途：核准藥物交互作用
資料規模
| 來源 | DDI 數量 | 更新日期 |
|---|---|---|
| DDInter | 222,391 筆 | 2026-02-08 |
| GtoPdb | 4,636 筆 | 2026-02-08 |
資料更新頻率
| 資料類型 | 更新頻率 |
|---|---|
| TxGNN 預測 | 模型版本更新時 |
| 臨床試驗 | 報告產出時 |
| PubMed 文獻 | 報告產出時 |
| TFDA 許可證 | 報告產出時 |
| DDI 資料 | 每季建議更新 |
授權與引用
使用本專案資料時，請同時引用原始資料來源。
TxGNN 引用
@article{huang2023txgnn,
title={A foundation model for clinician-centered drug repurposing},
author={Huang, Kexin and others},
journal={Nature Medicine},
year={2023},
doi={10.1038/s41591-023-02233-x}
}
本專案引用
@misc{twtxgnn2026,
title={TwTxGNN: Taiwan Drug Repurposing Validation Reports},
url={https://twtxgnn.yao.care},
year={2026}
}