藥物交互作用資料來源

本文件記錄 TwTxGNN 專案使用的藥物交互作用資料來源，便於定期更新。

資料總覽

類型	資料來源	記錄數	最後更新	授權
DDI (藥物-藥物)	DDInter 2.0	302,516	2026-02-08	CC BY-NC-SA 4.0
DFI (藥物-食物)	DDInter 2.0	857	2026-02-21	CC BY-NC-SA 4.0
DDSI (藥物-疾病)	DDInter 2.0	8,359	2026-02-21	CC BY-NC-SA 4.0
DHI (藥物-草藥)	精選資料集	35	2026-02-21	-

DDI - 藥物-藥物交互作用

資料來源：DDInter 2.0

網站：https://ddinter2.scbdd.com/
論文：DDInter 2.0 (Nucleic Acids Research, 2024)
授權：CC BY-NC-SA 4.0

下載方式

方法一：網頁下載（分類檔案）

https://ddinter2.scbdd.com/download/

按 ATC 藥物分類下載 CSV：

Code A: 消化道及代謝藥物
Code B: 血液及造血器官藥物
Code D: 皮膚病藥物
Code H: 全身性荷爾蒙製劑
Code L: 抗腫瘤及免疫調節劑
Code P: 抗寄生蟲藥物
Code R: 呼吸系統藥物
Code V: 其他藥物

方法二：API 端點

# 取得 DDI 資料（需 POST 請求）
curl -X POST "https://ddinter2.scbdd.com/server/interaction-source/" \
  -d "draw=1&start=0&length=1000"

資料格式

DDInterID_A,Drug_A,DDInterID_B,Drug_B,Level
DDInter1263,Naltrexone,DDInter1,Abacavir,Moderate

Level: Major / Moderate / Minor

本地檔案位置

data/external/ddi/ddinter/
├── ddinter_code_A.csv
├── ddinter_code_B.csv
├── ddinter_code_D.csv
├── ddinter_code_H.csv
├── ddinter_code_L.csv
├── ddinter_code_P.csv
├── ddinter_code_R.csv
└── ddinter_code_V.csv

DFI - 藥物-食物交互作用

資料來源：DDInter 2.0

網站：https://ddinter2.scbdd.com/
統計：857 筆 DFI，涵蓋 29 種食物
授權：CC BY-NC-SA 4.0

API 端點

# 取得完整 DFI 資料
curl -X POST "https://ddinter2.scbdd.com/server/food-interaction-source/" \
  -d "draw=1&start=0&length=1000"

回應格式

{
  "draw": 1,
  "recordsTotal": 857,
  "recordsFiltered": 857,
  "data": [
    {
      "id": 1,
      "drugName": "Calcium lactate",
      "foodName": "spinach",
      "internalID_a_id": "DDInter278",
      "level": "2",
      "references": "...",
      "newInteraction": "Administration with food may increase...",
      "newManagement": "Calcium may be administered with food...",
      "magnesium": "Absorption"
    }
  ]
}

level: 1=Major, 2=Moderate, 3=Minor
magnesium: 實際是機制欄位（Absorption/Metabolism/Synergy/Antagonism）

本地檔案位置

data/external/dfi/
├── ddinter2_dfi_raw.json      # API 原始回應
└── ddinter2_dfi_processed.json # 處理後的資料

更新腳本

uv run python scripts/process_ddinter_dfi.py

DHI - 藥物-草藥交互作用

資料來源：精選資料集

DDInter 2.0 不提供 DHI 資料，目前使用手動精選的資料集。

資料來源參考

來源	狀態	說明
Natural Medicines Database	需訂閱	最完整的 DHI 資料庫
PHYDGI	非公開	Synapse Medicine 商業資料庫
DrugBank	需申請	學術授權可免費
TCMBank	待確認	中藥資料庫，可能含 DHI
DDInter 2.0	規劃中	論文提到未來會支援 DHI
臨床文獻	手動整理	目前使用此方式

注意：目前公開可下載的 DHI 資料庫非常有限，因此使用手動精選。待 DDInter 2.0 支援 DHI 後可改為自動更新。

涵蓋草藥

草藥	英文名	主要機制
聖約翰草	St. John's Wort	CYP3A4/P-gp 誘導
銀杏	Ginkgo	抗血小板作用
人參	Ginseng	多重途徑
大蒜	Garlic	抗血小板/CYP3A4
紫錐花	Echinacea	免疫調節
卡瓦	Kava	CNS 抑制/肝毒性
纈草	Valerian	CNS 抑制
甘草	Licorice	礦物皮質素作用
當歸	Dong Quai	增強抗凝血
綠茶	Green Tea	維生素 K/CYP

本地檔案位置

data/external/dhi/
└── dhi_curated.json   # 精選資料集（35 筆）

DDSI - 藥物-疾病注意事項

資料來源：DDInter 2.0

網站：https://ddinter2.scbdd.com/
統計：8,359 筆 DDSI，涵蓋 115 種藥物
授權：CC BY-NC-SA 4.0

API 端點

curl -X POST "https://ddinter2.scbdd.com/server/disease-interaction-source/" \
  -d "draw=1&start=0&length=1000"

回應格式

{
  "draw": 1,
  "recordsTotal": 8359,
  "recordsFiltered": 8359,
  "data": [
    {
      "id": 1,
      "drugName": "Abacavir",
      "diseaseName": "Liver Diseases",
      "internalID_a_id": "DDInter1",
      "level": "3",
      "text": "Hepatotoxicity including lactic acidosis...",
      "references": "..."
    }
  ]
}

level: 1=Major, 2=Moderate, 3=Minor

本地檔案位置

data/external/ddsi/
├── ddinter2_ddsi_raw.json       # API 原始回應
└── ddinter2_ddsi_processed.json # 處理後的資料

更新腳本

uv run python scripts/process_ddinter_ddsi.py

更新流程

手動更新

DDI 更新

# 從 DDInter 2.0 下載頁面下載最新 CSV
# https://ddinter2.scbdd.com/download/
# 放置到 data/external/ddi/ddinter/

DFI 更新

uv run python scripts/process_ddinter_dfi.py

DHI 更新
- 手動編輯 data/external/dhi/dhi_curated.json
- 執行 uv run python scripts/integrate_dfi_dhi.py

自動更新（GitHub Actions）

參見 .github/workflows/interaction-update-check.yml

版本歷史

日期	更新內容
2026-02-21	整合 DDInter 2.0 DFI 資料（857 筆）
2026-02-21	建立 DHI 精選資料集（35 筆）
2026-02-08	下載 DDInter DDI 資料（分類檔案）

聯絡資訊

DDInter 2.0 團隊：http://www.scbdd.com/

論文引用：

@article{ddinter2,
  title={DDInter 2.0: an enhanced drug interaction resource},
  journal={Nucleic Acids Research},
  year={2024},
  doi={10.1093/nar/gkae716}
}